沒能位列「雲台二十八將」之人，女兒為皇后，戰功赫赫被劉秀猜忌

第一，在統一戰爭當中給劉秀出謀劃策，消滅隗囂軍事集團。<br />
隗囂是新莽時期到東漢初期的軍閥頭領，早年被更始帝封為右將軍。劉秀稱帝后，隗囂有投靠劉秀的打算，甚至做出了行動。但在部將王元的挑撥下，隗囂打算佔據隴西地區，稱霸一方。馬援多次對隗囂寫信，隗囂認為馬援背叛了自己，看到信件后非常發火。馬援隨即向劉秀陳述平定隗囂的策略。劉秀採納了馬援的策略，給馬援5000多人的騎兵，遊說隗囂集團的將領高峻等人，陳述利害關係，從而分化瓦解隗囂集團。<br />
32年，劉秀御駕親征，出兵攻打隗囂集團。剛開始，劉秀對是否能殲滅隗囂集團心裡沒底。劉秀徵求馬援的建議，馬援表示，隗囂已經分崩離析如果加強進攻定能獲勝。說完，馬援又在劉秀面前用稻穀大米堆積成戰場地形的沙盤圖，然後利用地形山川詳細介紹如何排兵布陣消滅敵軍。等於馬援給劉秀制定了一套完整的作戰方案，劉秀信心滿滿，決定進軍。<br />
戰鬥打響后，劉秀得到了竇融的大力支持。竇融出動河西五郡的部隊，以及小月氏和羌族的部隊共步兵騎兵數萬人和漢軍並肩作戰。最終，漢軍消滅了隗囂軍事集團。通過此戰，馬援初次顯露馬援卓越的軍事才能。