「我不相信耶穌的登山寶訓(Sermon on the Mount),我不是那種經常去教堂的人。基督教的某些東西我個人不是很相信。」當蓋茨被問到自己是否相信上帝時這樣說,「就做事來說,我用一個很科學的態度看待世間萬物。我不知道上帝是否存在。」
更令宗教人士介懷的是,蓋茨認為,就分配時間資源來說,宗教似乎很沒有效率,因為在他眼裡,「星期日的早上可以用來做更多有意義的事情」。因此,也難怪很多對Windows操作系統又愛又恨的人——當然多數是信仰上帝的教徒——會這樣諷刺蓋茨:「如果用基督教的觀點去經營自己的王國,如今的微軟也不會拿些Windows NT 或Windows 98之類的劣質品來愚弄大眾,如今的蓋茨基金更不會拿著錢去傷害無辜的嬰兒了。」