進化論在真理上的種種謬誤

可以這樣解釋，世界上的事物看似雜亂無章，但實際上都是服從某種分佈。比如人類的身高、體重，服從正態分佈。

在隨機過程中，把時間因素考慮進來，這個時候，事物往往服從泊松分佈。比如，超市收銀台的顧客數量；某個生態群落中，細菌的生存和死亡，等等。

（小知識：破送分佈是如何被發現的？破送分佈第一次被發現，是觀察到拿破崙軍隊中驢子的死亡數量隨著時間的推移是有規律的。以後發現許多事物，都是隨著時間的推移遵循泊松分佈的）

而且，如果想要建立隨機模型，一般都必須「假設」它服從某種分佈。

但是，其一，這種「假設」不是憑空的，而是你有前人的大量經驗數據后，你才有信心認為它服從此分佈，而非彼分佈。在統計學中，把大量經驗數據的收集稱為「訓練」。比如說，在神經心理學中，需要「訓練」出一個可以模擬腦神經的「神經元網路」。

其二，假設服從某種分佈，是建立模型，進行deduction的前提。如果不做假設，你就寫不出模型的公式。

所以，此「假設」非彼「假設」，呵呵

其一，有"大量transposon insertion數據"來「假設」transposon insertion是遵循泊松分佈嗎?
其二, 有人根據這個隨機「假設」, 算過7786個transposon insertion的概率嗎?

回到問題"人和黑猩猩2%的不同是7786個transposon insertion隨機插入的差別"
有沒有數據證明, 從7786 => 786=>78=>7=>1? 是不是說, 人類是來源於一對"猩猩人"?

[ 本帖最後由 柏桐 於 2007-9-20 21:48 編輯 ]

這也是我的疑問，如插入是隨機的，同種個體間亦應有很大差異，如同種只有一種譜，那意味這這種來源於一個個體，但我們觀察到的卻是，維繫種群，個體少了是不行的。

transposon的譜系是如何處理個體間差異的，個體間有沒有差異／

個體間當然有差異. 那是DNA親緣鑒定的基礎.

每個物種都有一個background 上相同的"譜", 在此基礎上又有新的活動造成的新的個體差異.

一個有利生存基因突變發生在某一個體上, 他的一些後代會經遺傳獲得這一基因. 幾代后, 就會有一個subpopulation擁有這一基因. 在這一sub population里某個體再次發生有利突變, 這樣積累下去, 就產生新種. 理論上, 每個物種都可以追到一個common ancestor的. 有興趣可以看Richard Dawkins 的selfish gene.

我們比的就是物種的這個"background" "譜".

原帖由 柏桐 於 2007-9-20 21:17 發表
其一，有"大量transposon insertion數據"來「假設」transposon insertion是遵循泊松分佈嗎?
...

實話實說，這個問題偶不知道。汗一下。。。。  偶不是學生物的，偶可以回答關於隨機過程和統計學的問題，但是生物問題，黑窗帘同學更有發言權吧

原帖由 柏桐 於 2007-9-20 21:17 發表
其二, 有人根據這個隨機「假設」, 算過7786個transposon insertion的概率嗎?

這個問題偶也不知道，再汗一下。。。。

如果偶的概率統計知識沒錯的話，根據黑窗帘同學對transposon insertion的解釋，一次transposon insertion后，gene的性質會發生改變，所以這7786次，應該是「條件概率」問題。而不是簡單的7786次獨立事件相乘。呵呵

原帖由 在美一方 於 2007-9-19 05:51 發表
哪裡，我還沒有senior到那個地步，雖然我也審別人的論文（確實斃的多些），但也還在戰戰兢兢等reviewer們開恩的階段

哇，美姐你能做reviewer的時候，我來寫一篇搗搗漿糊吧，不要斃掉我哦  

原帖由 iamrabbit 於 2007-9-21 07:20 發表

實話實說，這個問題偶不知道。汗一下。。。。  偶不是學生物的，偶可以回答關於隨機過程和統計學的問題，但是生物問題，黑窗帘同學更有發言權吧

這個問題偶也不知道，再汗一下。。。。

...

估計黑窗帘同學也不知道. 對於"transposon insertion是隨機的". 很可能是個假設, 還沒有充分的數據.
我不懂分子生物學, 但知道一些大分子(polymer)科學. DNA 是屬於大分子(polymer)的一種. 目前, 可以人工合成少量類似 insertion的co-polymer, 如ABAB, ABCABC..... . 從有機或大分子合成的角度看, 人應該可以合成任何一種有機物, 特別是已知的. 只是太多的變數, 很多規律還沒有被發現和掌握. 同樣transposon insertion不一定是隨機的, 而可能是不知道原理.

原帖由 柏桐 於 2007-9-21 21:03 發表

估計黑窗帘同學也不知道. 對於"transposon insertion是隨機的". 很可能是個假設, 還沒有充分的數據.
我不懂分子生物學, 但知道一些大分子(polymer)科學. DNA 是屬於大分子(polymer)的一種. 目前, ...

Transposon 插入不是隨機的，它必須遵循同源識別的規律。據個例子來說，LTR 是retro-transposon，他在轉移時必需轉到有LTR的識別位點上。沒有識別位點的插入是不可想象的。不知黑窗帘有沒有隨即插入的證據。

原帖由 研究 於 2007-9-21 07:22 發表
Transposon 插入不是隨機的，它必須遵循同源識別的規律。據個例子來說，LTR 是retro-transposon，他在轉移時必需轉到有LTR的識別位點上。沒有識別位點的插入是不可想象的。不知黑窗帘有沒有隨即插入的證據。

本來今天兩個死期，不打算說話。看到這裡不得不說一句，您舉的 retrotransposon 這是class I transposon，使用的是copy/paste機制。那Class II 呢？也不能隨機插入么？

原帖由 在美一方 於 2007-9-21 21:37 發表


本來今天兩個死期，不打算說話。看到這裡不得不說一句，您舉的 retrotransposon 這是class I transposon，使用的是copy/paste機制。那Class II 呢？也不能隨機插入么？

你的邏輯和科學訓練哪裡去了？只要有任一種transposon不能隨機插入，「transposon插入是隨機的」就被證偽了。

原帖由 柏桐 於 2007-9-21 21:03 發表

從有機或大分子合成的角度看, 人應該可以合成任何一種有機物, 特別是已知的. 只是太多的變數, 很多規律還沒有被發現和掌握. ...

以下只是學術探討，呵呵，可能是在各自的知識領域，各說各話了。不過，從這個帖子的所有討論中，還是非常長知識的。

偶說一下偶熟悉的一些問題。

其一，從多變數分析的角度，「變數太多」不是一個大問題。偶曾經做過42-105個變數的統計分析，統計學現在已經有非常成熟的多變數分析手段，用以發現和掌握規律。

其二，破送過程是目前為止人們發現的一個比較帶普遍性的隨機分佈，很多隨時間推移的現象，都是符合破送過程的。但是，如果人們發現了另一個過程，比如隨機插入這件事符合另一個隨機過程，發現的人，絕對拿諾貝爾獎。可能是生物加數學雙獎。

200w美刀啊！流口水

對 $$ 流口水的人，是絕對拿不到諾貝爾獎的；同樣，計劃要拿諾貝爾獎的人，也是絕對拿不到諾貝爾獎的。想過為什麼嗎？

偶從來沒想過那諾貝爾獎啊。

偶可以自己設個獎，自己拿，HOHO

原帖由 iamrabbit 於 2007-9-22 05:42 發表



以下只是學術探討，呵呵，可能是在各自的知識領域，各說各話了。不過，從這個帖子的所有討論中，還是非常長知識的。

偶說一下偶熟悉的一些問題。

其一，從多變數分析的角度，「變數太多」不是一個大問題。偶曾經做過42-105個變數的統計分析，統計學現在已經有非常成熟的多變數分析手段，用以發現和掌握規律。

42-105個變數? 想知道那資料庫是多大啊?
在科研中, 如果DOE 是42個變數, 要有多少實驗?

這個帖子太長了，偶開個新貼吧。正好相應一下大S讓咱們信仰版周年隨喜的號召。呵呵