矽谷「黃埔軍校」揭曉抗癌新方法：用演演算法找病變基因

　　2017年07月21日 13:07 PingWest　　微博微信空間添加喜愛

　　當我們談起矽谷，我們在談什麼？惠普、蘋果、Google、Facebook、特斯拉、SpaceX的黑科技，還有每隔幾年就會突然出現在公眾視野里的小型初創公司。

　　其實，還有另一群神秘的天才，在矽谷少為人知的非營利研究機構里，用一項又一項研究成果低調地改變著我們的世界……

　　SRI International（斯坦福國際研究院）就是這樣一家機構。過往在這裡誕生並被大公司收購或拆分出去成立公司的明星項目數不勝數：汰漬洗衣液基礎原料、支票磁性安全墨水、滑鼠原型機、噴墨印表機、光碟以及LCD顯示器的發明，以及世界首次網際網路通信的實現……

　　

　　就連蘋果操作系統里的智能助手Siri，一開始也是SRI International的內部創業項目。

　　稱這家機構為矽谷的黃埔軍校絲毫不過分……

　　SRI International的研究方向還包括醫學，他們正在研究如何及早診斷和攻克癌症！

　　之前醫學界早有研究發現，一些癌症由成對的基因A和B控制，它們被稱為「合成致死基因」(Synthetic Lethals)。假設A基因病變失靈，B則會擴大表達量以彌補A的損失，維持癌細胞繼續增生，反之亦然。如果能夠使A和B同時病變，它們控制的癌細胞就會死亡，癌症會停止擴散。

　　

　　於是，醫學界開始著手利用這個理論發展醫藥和救治方案，結果卻並不理想——門檻在於，想要精確地確認這種成對基因關係，就像大海撈針一樣。

　　而SRI International的生物信息學小組，在醫學和計算機專家，斯坦福大學研究員蘇巴娜·辛(Subarna Sinha)的帶領下，取得了重大突破！

　　

　　該小組開發出了一種全新的計算機演演算法，命名為「導彈」(Mining Synthetic Lethals, MiSL)。

　　

　　通過新演演算法，小組對12種不同類型的癌症、超過3100個癌症相關基因病變、數以億計的基因進行篩選，精確地篩選出了89對合成致死基因。更令人欣慰的是，這其中有17對在此之前已經被發現，投入臨床應用或藥物開發——證明了MiSL演演算法的有效性！

　　在PingWest品玩上周舉辦的矽谷科技峰會SYNC2017上，辛向在座數百名專業人士具體闡釋了這一新發現。據她介紹，MiSL不僅可以用來發現潛在的合成致死基因，還可以導入新的數據源進行反向驗證，找到那些導致對已有癌症藥物產生抗藥性的基因，從而擴展出新的研究……

　　

　　辛指出，MiSL演演算法的誕生，在對抗癌症的戰爭中具有里程碑的意義。通過MiSL，未來我們可能會迎來對個體病人更具針對性的抗癌療法，甚至在某天完全擊敗癌症……