從界面的美觀性而言,「木馬防線」無疑是其中最具現代感的,尤其是圖標的設計靚麗動感,色彩搭配合理,還可切換界面(僅顯示掃描控制面板)。而「木馬清除大師」則採用了仿Windows Media Player的界面,以及專用的滑鼠指針,顯得較為個性化。「木馬剋星」的托盤圖標製作得比較精緻有特色,而且支持更換界麵皮膚(但程序未預置皮膚文件),不過程序窗口始終置頂不利於其它窗口的切換。而其它幾款軟體的界面則顯得比較中規中矩,但也還算簡潔清爽。唯有「Windows木馬清道夫」的界面仍然是Windows 98時代的老面孔,而且布局稍顯凌亂。