方文一上來就指責丁文「不過是在重複美國基督教傳教士的宣傳」。丁林似乎對方舟子這種亂貼標籤的做法有所預見,所以在引子部分就率先明確申明了「我們不是基督徒。我們記下這篇文章,不是出於對某種特定宗教特定信仰的褒揚」。丁林介紹說「美國公共電視台(PBS)曾經播放過一個一小時的專題節目,題為《信仰和理性》(Faith and Reason),談科學理性和基督教信仰的互動問題。這是一個主要由著名科學家和神學家發表議論的節目。」我想這一方面是在說明丁文的主旨是科學理性和宗教(基督教)信仰的關係,另一方面也說明丁文的資料來源並非是「美國基督教傳教士的宣傳」。方舟子的指責顯然是非常武斷和不顧事實的。