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新冠病毒神秘來源 (轉載)

作者:文廟  於 2020-2-23 03:00 發表於 最熱鬧的華人社交網路--貝殼村

作者分類:是非曲直|通用分類:熱點雜談|已有13評論

關鍵詞:新冠, 病毒, 來源, 武漢

序言: <新冠病毒神秘來源> 一文,出現於大陸平台《微信》之中。至本博轉載時,尚未被封閉。據報道,武漢肺炎新冠狀病毒的基因序列於202012日完成,而病毒於15日分離成功。中國科學家於2020110日,即中國政府公開疫情之前, 搶先投稿和發表論文,公布了完整的新冠狀病毒基因序列。該研究不但通報了全世界,也將實情公佈於眾,為國際合作發展病毒的疫苗,及診斷和治療提供了基礎。按國際慣例,該病毒基因序列儲存於位於美國的兩大基因庫,NCBI (國立衛生研究院)和 UC_SC (加州大學)的開放平台,可供任何人士瀏覽,比較和進行基因來源的研究。

拜訪和諮詢多位有關的專家,本博一直追蹤武漢肺炎新冠狀病毒的來源。例如,應用UC_SC (加州大學)的平台:https://eurekalert.org/pub_releases/2020-02/uoc--ugb020720.php  UCSC genome browser posts the coronavirus genome。自220 日起,有報道稱,北京策動所有的力量,闢謠新冠狀病毒的來源。大量的應時文章,也開始出現於各個媒體。在無基本科學根據的情況下,否認新冠狀病毒的重組性質,更否認有人工介入的可能性,這是極不負責的行為。與此同時,UC_SC 的新冠狀病毒開放平台被無理由的關閉一天。可見,新冠病毒確實是個神秘的東西。為防止<新冠病毒神秘來源> 一文再次失聯,本博轉載如下,供網友參考和查驗。

原編者按:隨著武漢新冠肺炎對全球的威脅與日俱增,越來越多的各國專家也對新冠病毒COVID-19SARS-CoV-2)的來源投下更多關注的目光。本文從流行病學調查、病毒基因比對、跨物種感染研究以及關鍵的中間宿主等五大領域,對新冠病毒來源進行了全景式梳理與深度挖掘,為讀者提供一個深刻而全新的視角。

新冠病毒神秘來源  作者 劉永; 發表日期 2020217

一、華南海鮮市場:備受爭議的「疫源地」
二、病毒學證據:武漢新冠病毒COVID-19的基因異樣之處
三、石正麗:疑雲籠罩的冠狀病毒跨物種感染研究
四、穿山甲之謎:突如其來的「中間宿主」
五、武漢病毒所:輿論風暴中心的P4實驗室

【正文】

自從武漢爆發新冠肺炎迄今,已經過去了兩個月,但科學界對這個神秘的新冠狀病毒「COVID-19」(也叫SARS-CoV-2WHO舊稱2019-nCoV,本文簡稱(新冠病毒)的認識依然十分有限。此次疫情爆發的源頭是華南海鮮市場嗎?備受關注的武漢P4病毒研究所在其中究竟扮演了什麼角色?中共官方堅稱新冠病毒來自原始宿主蝙蝠,華南農業大學幾位學者甚至聲稱他們找到了中間宿主穿山甲。但科學界對病毒基因序列的研究以及大量科學文獻的比對查證,均顯示這個病毒的來源並非如此簡單。

一、華南海鮮市場:備受爭議的「疫源地」

這場來勢兇猛的大疫第一次闖入公眾視野,是網路流傳的一份武漢市衛健委內部通知,這份通知明確寫道:「我市華南海鮮市場陸續出現不明原因肺炎病人」,並要求各醫療單位統計類似的不明原因肺炎病例上報衛健委醫政醫管處。


華南海鮮市場位於湖北武漢市江漢區,是一個包含了豬肉供應以及各種海鮮凍品、冰鮮、乾貨及調味品在內的大型綜合市場,也包括販賣一些野味。

當「不明肺炎」陡然出現在大眾面前的時候,「野味」這個詞無疑迅速成為最受關注的焦點。畢竟,十七年前的「薩斯」瘟疫大爆發,就一直被官方認定為是廣東人吃野味「果子狸」而惹出的大禍。

20191231日,武漢市衛健委首次公開發布通報稱,近期部分醫療機構發現接診的多例肺炎病例與華南海鮮市場有關聯。202011日,華南海鮮市場貼出休市公告,隨後進行了徹底的環境衛生整治——知名香港薩斯專家管軼後來痛斥,這個舉措等於摧毀了「犯罪現場」。

此後,武漢方面多次強調,多數武漢肺炎病例有華南海鮮市場暴露史或接觸史。中國疾控中心病毒病所也分別於11日、12日兩次在該市場取樣共585份,並轉運至實驗室進行檢測。

122日,國家疾控中心主任高福在國務院新聞辦公室發布會上表示,武漢新型冠狀病毒的來源是武漢一個海鮮市場非法銷售的野生動物。

126日,中國疾控中心病毒病所稱,該所首次從華南海鮮市場的585份環境樣本中,檢測到33份樣品含有新型冠狀病毒核酸,並成功在陽性環境標本中分離病毒,提示該病毒來源於華南海鮮市場銷售的野生動物。

至此,華南海鮮市場是疫源地的說法成為官方定論。

然而,令人始料未及的是,僅僅一天之後,《科學》雜誌於27日在線發表的一篇報導就對中共官方這一結論提出重大挑戰。

該報導引述了世界頂級醫學雜誌《柳葉刀》的一篇論文,質疑武漢新型冠狀病毒肺炎的疫源地可能並非華南海鮮市場。

這篇論文題為「新型冠狀病毒感染患者的臨床特點」[1]124日在《柳葉刀》上發表。論文第一作者是武漢市首家不明肺炎指定收治醫院金銀潭醫院的副院長黃朝林,其餘作者包括了該院其他臨床醫生以及多家研究機構的成員。

這篇論文透露出以下關鍵信息:

# 第一例病人發病時間是121日,與海鮮市場無關聯;
#
第一例病人與後續病人未發現流行病關聯;
# 12
10日,又有3例病例發病,其中2例與華南海鮮市場無關聯;
# 12
15日開始,有海鮮市場暴露史的病例集中出現;
#
論文統計總共41例病人,有14例證實與海鮮市場無關聯,比例超過1/3
#
海鮮市場沒有人賣蝙蝠,也未發現蝙蝠的蹤跡。


不僅如此,129日《柳葉刀》再發論文分析了金銀潭醫院99例確診病例,其中有50例無海鮮市場接觸史;而《新英格蘭醫學雜誌》也有論文顯示:22日前確診的全部425個病例中,11日前發病者有45%無海鮮市場接觸史。

而對比官方的通報可以看到,二者有明顯差異。官方通報的相應信息如下:

# 第一例病人發病時間是128日,與海鮮市場有關聯;
#
官方認定華南海鮮市場就是疫源地,未提首例病人無海鮮市場接觸史及上述1/3病例無海鮮市場暴露史的數據。
武漢病毒所石正麗等人於123日發表論文,指從雲南馬蹄蝠身上發現新冠狀病毒,與武漢新冠病毒同源性達96.2%,病毒源自蝙蝠就此成為大眾共識。


柳葉刀》論文與中共官方通告內容對比圖

美國喬治敦大學(University of Georgetown)傳染病學家丹尼爾魯西(Daniel Lucey)針對《柳葉刀》的論文表示,如果該論文的數據是準確的,那麼第一個病例應該在201911月就已被病毒感染,因為在感染之後和與出現癥狀之前有一個潛伏期。此前有專家表示,新型冠狀病毒的潛伏期在10天~14天左右。

很明顯,這意味著在1215日開始集中出現有華南海鮮市場暴露史的病例之前,病毒就已經在武漢的某些地方和某些人之間悄無聲息地傳播。魯西坦率地指出:「中國肯定已經意識到這種流行病並非源自武漢華南海鮮市場。」

《柳葉刀》論文的通訊作者之一、北京首都醫科大學教授曹彬回復美國科學新聞網站ScienceInsider時也表示:「目前比較明確的是,(華南)海鮮市場應該不是新型冠狀病毒的唯一發源地。」;「但老實說,我們現在仍然不知道病毒究竟從哪裡來。」(」Now It seems clear that [the] seafood market is not the only origin of the virus, he wrote in an e-mail to ScienceInsider, But to be honest, we still do not know where the virus came from now.」)

值得注意的是,《柳葉刀》的兩篇論文和《新英格蘭醫學雜誌》論文的作者都是中國大陸的醫生和醫學專家。而與此相左的則是,中共國家級專家組的做法顯示,他們似乎有意無意在忽視這一極其重要的信息。

國家衛健委第一個專家組早在20191231日就已到達武漢。據大陸財新網對武漢大學中南醫院重症醫學科主任彭志勇的採訪[2]證實,這個專家組到武漢金銀潭醫院調查后即制定了一套診斷標準:要有華南海鮮市場接觸史;要有發燒癥狀;全基因組測序。三條標準都達到才能確診,缺一不可。

一批國家級專家組制定的確診三指標

彭志勇說,這個標準直到鍾南山等第二批專家組18日到達武漢后才修改。

這就產生出一個難以解釋的問題:第一批專家組對《柳葉刀》調查的這41例病例的詳細情況,應該是了解的。因為武漢衛健委官方通報中,從110日到117日,確診41例這個數字一直沒有發生任何變化。

為什麼專家組在明知至少1/3的病例與海鮮市場無關聯的情況下,要硬性規定確診標準中必須有「海鮮市場接觸史」這一條?

稍有傳染病醫學常識的人都知道,查清真正的傳染病源,是防控傳染病的三大關鍵之一。既然有非常明確的流行病學證據和最早參與調查疫情的同行專家的判斷都顯示華南海鮮市場並非病毒疫源地,為何專家組要強行「規定」要有海鮮市場接觸史?

二、病毒學證據:武漢新冠病毒COVID-19的基因異樣之處 E蛋白】

110日是一個重要的日子,在這一天,中國正式向全世界公開了武漢新冠病毒(以下簡稱武漢病毒)的全基因序列。全世界最頂尖的病毒學專家立即對這個神秘的病毒開展深入研究,並開始陸續發表各自對新冠病毒的研究報告。

在通過對武漢新冠病毒基因進行整體分析后,希臘一個專家團隊於2020127日發布報告[3]說,他們研究分析了武漢病毒的遺傳關係,發現「新型冠狀病毒的基因,大約五成與sarbecvirus亞屬中的其它病毒沒有密切的遺傳關係」,並且該病毒具有其它任何冠狀病毒都不具有的特殊中間區段,而這段基因恰好就是幫助病毒入侵宿主細胞的關鍵。

這些研究發現表明:武漢病毒是一種新型的冠狀病毒,且推翻了作者原來認為的武漢病毒起源於不同冠狀病毒之間的隨機自然突變的假設。換言之,作者認為武漢病毒並非靠自然演變而來。

希臘專家的發現並非孤例。早在17日,中國疾控中心研究院張永振院士和復旦大學公共衛生學院就聯名向《自然》雜誌提交了論文[4],並於23日發表。該論文明確提出,武漢病毒與中共軍方的兩種舟山蝙蝠病毒樣本CoVZC45CoVZXC21存在最為密切的親緣關係。其中,武漢病毒與CoVZC45病毒的核苷酸序列同一性為89.1%,甚至在nsp7和包膜蛋白(E蛋白)方面表現出100%的氨基酸相似性。


張永振等人向《自然》雜誌提交的論文顯示,武漢新冠病毒和舟山蝙蝠CoVZC45病毒E蛋白相似度高達100%。(《自然》論文截圖)

很快,有專家利用美國國立衛生研究院(NIH)生物科技信息中心(NCBI)的比對工具BLAST,對中共官方12日第三次提交的基因組序列進行基因比對,證實了張永振的發現。[5]


粉紅高亮區的信息顯示,武漢海鮮市場病毒樣本與編號為「AVP78033.1」的病毒樣本比對,其E蛋白相似度高達100%(G-NEWS)

中國疾病中心專家陸柔劍的團隊也於130日在《柳葉刀》上發表論文[6]指出,武漢新冠病毒和此前在中國浙江舟山蝙蝠身上發現的一種冠狀病毒整體相似度非常高,達88%

舟山蝙蝠身上攜帶的這種冠狀病毒,其最早發現者是南京軍區軍事醫學研究所的專家。該所於2018年發表英文論文[7],宣布在舟山蝙蝠身上發現一種新型冠狀病毒——舟山蝙蝠類SARS冠狀病毒,為方便理解,本文簡稱其為「舟山病毒」。

綠色高亮區顯示,編號為「AVP78033.1」的病毒樣本來自南京軍區軍事醫學研究所,即舟山病毒(G-NEWS)

微生物學博士、美國前Walter Reed陸軍研究所病毒系實驗室主任肖恩林(Sean Lin)認為,武漢病毒和舟山病毒的E蛋白氨基酸序列達到100%一致,是一件極其不尋常的事情。因為E蛋白對於β型冠狀病毒的病毒形態、組裝、出芽以及病毒致病性都有不可或缺的作用。如果病毒更換了宿主,很多細胞因子都會變化,E蛋白也必然有相應的變化來調整病毒的合成和致病性。

他進一步指出:E蛋白的基因和S蛋白的基因位置鄰近,在病毒RNA的複製過程中,這兩個基因也都是要經過一個產生亞基因組RNA subgenomic RNA)來完成複製的,也牽扯類似的細胞內因子和病毒RNA聚合酶,所以這個過程中產生基因複製的錯誤率也都是相近的。所以,沒有理由在自然的病毒複製過程中,S蛋白有著各種突變,而E蛋白在整個宿主都變換掉的情況下保持完全相似。這基本上是不可能自然發生的。

北京大學傳染病學博士、瑞士生物技術公司SunRegen Healthcare AG首席科學官董宇紅女士指出,根據陸柔劍在《柳葉刀》上發表的論文,冠狀病毒科內與武漢病毒最近的幾種冠狀病毒,在其它蛋白(SMN等)的氨基酸序列上都不可能達到像E蛋白這樣的100%完全一致,一致度為73.2%98.6%。那麼,這個E蛋白為什麼在武漢病毒中與所謂「祖先」的蝙蝠病毒保持如此大的一致性,值得深入探究(Lu et al 2020 Lancet)。

她表示,與SMN蛋白相比,雖然E蛋白是武漢病毒主要的結構蛋白質中的最小的一個蛋白,可是它的功能並不能小看。武漢病毒在人體複製周期中,E蛋白在受感染的人體細胞內大量表達,大部分E蛋白被定位在人體細胞內轉運的關鍵位點,如內質網、高爾基器等,參與冠狀病毒的組裝和出芽。缺乏E蛋白的重組,冠狀病毒展示病毒滴度顯著降低,病毒成熟度降低或繁殖能力不強,表明E蛋白在與宿主細胞之間起到的重要相互作用,尤其是在病毒繁殖、成熟、傳播能力方面的重要性,也應該是決定病毒在人種中的傳播力的一個重要功能蛋白。

簡而言之,武漢病毒和舟山病毒表現出來有關E蛋白的這種完美一致性,用「自然變異」難以解釋。

S蛋白】

更蹊蹺的是,武漢病毒身上的費解之謎,還不止這一個。

2020121日,中國科學院上海巴斯德研究所分子病毒與免疫重點實驗室研究人員在《中國科學生命科學》(SCIENCE CHINA Life Sciences)上發表的一篇論文提到一個重要現象:武漢病毒的S蛋白一個關鍵部分的序列,和薩斯病毒具有高度同源性。

S蛋白是什麼?就是已經廣為人們熟悉的冠狀病毒圖片中,病毒表面那些一個一個的「小蘑菇」。這個S蛋白(也稱刺突蛋白、棘突蛋白)是冠狀病毒能夠入侵人體細胞的最重要工具。


SARS病毒結構圖(Joseph S Malik Peiris, Nature Medicine)

巴斯德研究所的專家們發現,薩斯病毒的S蛋白中第442472479487491位的殘基位於受體複合物界面,並且被認為是薩斯病毒跨物種及人際傳播至關重要的位點。[8]

令人驚訝的是,武漢病毒的S蛋白中有442472479487位這4個位點的殘基與薩斯病毒不同,但這種差異卻並沒影響到S蛋白的結構構像。就是說,武漢病毒的S蛋白依然保持著和薩斯病毒S蛋白一樣的結構,依然可以像薩斯那樣,在RBD結構域中共享幾乎相同的3-D結構,並藉此與人體細胞中的ACE2受體結合從而輕鬆入侵人體。

這是可以用精準來描述的基因變異,就像一把鑰匙上有5個卡齒,其中4個齒的材質發生了改變,但鑰匙的整體形狀卻完美保持,鑰匙依然可以打開通往人體的閥門。


新冠病毒S蛋白4個位點殘基的異常現象示意圖

美國哈佛大學資深流行病專家費格丁(Eric Feigl-Ding)博士也注意到這個異常現象,他於128日在推特上發文,引述希臘學者研究的最新發現指出:該病毒不是由冠狀病毒經過近期隨機結合而產生的,有些部分與所有冠狀病毒都「不協調」。其基因組的序列中段是以往冠狀病毒中從未見過的,可「編碼」侵入宿主細胞的刺突蛋白(S蛋白)。

【分子進化鍾&最近共同祖先】

分子進化鍾是一種通過基因突變速率來估算物種進化速率的技術,遠的可以追溯長達千百萬年的進化,短的可以追尋當前傳染病病原體的來源。

中國疾控中心病毒預防所的陸柔劍(Roujian Lu2020130日在《柳葉刀》期刊上發表論文[9],發現這次武漢肺炎來自不同患者的新冠病毒序列幾乎相同,序列同源性(sequence identity)超過99.9%。這一發現表明,新冠病毒是在很短時間內自一個起源地產生,而且相對較快地被檢測到。

世界著名的斯克里普斯研究所(The Scripps Research Institute)的分子生物學家克里斯蒂安安德森(Kristian Andersen)也發表題為「基於27個基因分析的生物鐘和最近共同祖先時間」的文章[10],分析了中國公開發表的27個武漢病毒完整基因,發現來自武漢、泰國、深圳等地的24個樣本的基因組非常一致,「顯示出非常有限的遺傳變異」,「表明所有這些病毒株都具有相對較新的共同祖先。」

安德森認為,病毒是單一來源進入人類,然後是持續地人傳人。這可以是單個動物或一小群最近被感染的動物感染給單一個人或一小群人。所有分析的案例都是人傳人,沒有動物傳人的。

他根據分子進化鍾算出來最先從人開始廣傳的時間,中間值是122日,最早可以是101日,這與後來中共官方公布第一個就診病例的121日相當吻合。雖然這兩篇論文都沒有猜測病毒的起源,但顯然排除了多個動物來源的可能性。

三、石正麗:疑雲籠罩的冠狀病毒跨物種感染研究

一個顯著的事實是,蝙蝠攜帶的冠狀病毒無法直接感染人體,更不是可以擁有人傳人能力的病毒。但隨著輿論對武漢病毒「被人工干預」的質疑聲越來越大,及武漢病毒所該所的知名病毒專家石正麗開始步入大眾視野。

2003年薩斯疫情爆發后,石正麗曾帶領團隊在全國各地採集蝙蝠樣本做病毒檢測,並於2013年將成果發表於《自然》雜誌上。2017年,石正麗團隊確定SARS病毒是經過幾個蝙蝠SARS樣冠狀病毒重組而來,一度引發普遍關注。

由於長期從事對蝙蝠及SARS病毒的研究,石正麗無疑已經成為冠狀病毒研究領域的權威,而且其本人更專註於冠狀病毒跨物種感染領域。

耐人尋味的是,石正麗對冠狀病毒S蛋白——這個跨物種感染人體的「通行證」——的研究,早在2010年就已經開始。石正麗團隊對尋找冠狀病毒如何跨越物種障礙發生傳播,進行了長期、系統且深入的研究。

2010年,石正麗團隊發表論文[11],用活SARS病毒和HIV(艾滋)偽病毒檢查不同種類蝙蝠ACE2對人類SARS-CoV刺突蛋白(S蛋白)的敏感性。實驗中他們還改變蝙蝠ACE2的幾個關鍵氨基酸,來測試其對S蛋白的結合性,並構建帶有SARS病毒BJ01-S蛋白的HIV偽病毒HIV/BJ01-S這顯示石正麗團隊已經意識到S蛋白與ACE2受體之間的特殊關係。


冠狀病毒通過S蛋白感染人體細胞示意圖

20131030日,石正麗團隊發布了冠狀病毒研究的「新突破」。《自然》雜誌刊發其題為「使用ACE2受體的蝙蝠SARS樣冠狀病毒的分離和鑒定」論文[12],包括葛行義、石正麗、達薩克等專家在內的研究團隊,發布了從雲南菊頭蝠(馬蹄蝠)身上分離出的新型冠狀病毒RsSHC014Rs3367的全基因組序列。石正麗負責提供了SHC014冠狀病毒S蛋白序列以及質粒,這是她一直以來最擅長的領域。

在這次的研究成果中,石正麗團隊還從蝙蝠糞便樣本中分離出了第三種新型蝙蝠冠狀病毒的活體——SARS樣冠狀病毒WIV1,其與Rs3367病毒的序列同源性為99.9%。該病毒的S蛋白可以通過受體結合點(RBD)結合人類受體ACE2,並有效地將SARS病毒直接傳染給人,不需要果子狸等中間宿主。

這毫無疑問是一個重要的突破,這個突破顯示石正麗等人已經初步掌握了冠狀病毒突破物種障礙直接感染人體的「鑰匙」。

2015119日,武漢病毒所石正麗團隊在英國《自然醫學》(Nature Medicine)雜誌上發表論文[13],主要內容是:他們成功製造出一種能自我複製的嵌合病毒,使具有前述RsSHC014冠狀病毒「S蛋白」的野生小鼠SARS冠狀病毒能結合人類ACE2,從而具有了跨物種的強大傳染力。在實驗結果中,感染了這種「合成」病毒的小白鼠兩肺嚴重病變,無葯可醫。


論文所附圖像局部。e為感染SARS冠狀病毒(黑色)和新型嵌合病毒(綠色)的小鼠,隨感染時間體重減輕的曲線。f顯示了小鼠感染這兩種病毒2天和4天後,病毒在肺部的複製情況。gh 分別顯示了小鼠從呼吸道感染SARS病毒和嵌合病毒后,肺部病變的影像。(Nature Medicine, CC)

令人驚心的是,在小白鼠身上的成功實驗僅僅只是石正麗的「牛刀小試」,他們接下來還準備在靈長類動物身上進行進一步的實驗。這個舉動無疑是危險的,因為這非常容易讓人聯想到,石正麗團隊是否在模擬如何使用這類嵌合病毒來感染人體。


石正麗關於冠狀病毒跨種感染研究的三部曲

石正麗這篇論文迅速引發了學術界的巨大爭議。法國巴斯德研究所的病毒學家西蒙韋恩霍布森(Simon Wain-Hobson)深切表達了這種擔憂,他告訴《自然》雜誌:「如果(新)病毒逃逸了,誰也無法預測其途徑。」

羅格斯大學分子生物學家兼生物防禦專家理查德埃布賴特(Richard Ebright)對《自然》說:「該研究的唯一影響是在實驗室中創造了一種新的非自然風險。」

但石正麗的步伐顯然並未停止。20181114日,石正麗應上海交通大學生命科學技術學院邀請,在該院樹華報告廳做了一次題為「蝙蝠冠狀病毒及其跨種感染研究」的主題演講。

在這次演講中,石正麗介紹了她帶領下的團隊如何使用「重組分析」發現人SARS病毒的最近祖先,可能是由雲南一個蝙蝠山洞中的三個病毒株(WIV1Rs4231Rs4081)重組而來的經過。

值得注意的是,出於不明原因,上海交大官方網站已經刪除了這篇報導。


(網頁截圖)

2020123日,時值新冠肺炎急速爆發、武漢宣布封城之際,石正麗團隊在bioRxiv預印版平台上發表文章《一種新型冠狀病毒的發現及其可能的蝙蝠起源》[14],提出此次武漢新型冠狀病毒或來源於蝙蝠。該論文隨後於23日在《自然》雜誌上刊登。

該文章提到,武漢新型冠狀病毒使用與SARS冠狀病毒相同的細胞進入受體(ACE2),也就是說,武漢新冠病毒使用和SARS相同的「鑰匙」來打開通向人體的大門。

文章還稱,他們發現新型冠狀病毒與源自雲南馬蹄蝠、編號為RaTG13的冠狀病毒的序列的一致性高達96.2%

眾所周知,中國國家疾控中心上傳武漢病毒的全部基因組序列是在111日。武漢病毒所在短短12天時間內就從病毒庫諸多的冠狀病毒中,比對、鎖定與之相似度最高的病毒,並且還做出分離、上傳基因庫,甚至寫出了論文。

相比上次找到SARS病毒天然來源花費了足足十年時間,這次石正麗團隊的效率高得驚人。

一個不易為人注意的細節是,石正麗127日提交RaTG13蝙蝠病毒的登記信息顯示,該病毒早在2013724日,就已從雲南馬蹄蝠(菊頭蝠)的糞便中被分離出來,其採集時間比石正麗201310月發表論文的時間還要早三個月,但石正麗的論文中並沒有提到這個特殊的病毒。

換言之,這個被視為很可能是引發這次瘟疫的元兇、極其重要的「新馬蹄蝠病毒RaTG13」在武漢P4實驗室被雪藏了七年時間。


病毒提交記錄顯示,新馬蹄蝠病毒RaTG13」採集時間是2013724日。(G-NEWS)

「新馬蹄蝠病毒」為何被雪藏七年?箇中原因誰也不知道,但石正麗現在報告說自己「發現」了該病毒和武漢病毒的聯繫,無疑是想證明,這個病毒就是武漢病毒的天然來源。

但一個難以解釋的現象是,病毒基因序列比對結果顯示,新馬蹄蝠病毒(RaTG13)與武漢病毒的包膜蛋白(E蛋白)和膜蛋白(M蛋白)基因片段ORF6,其氨基酸序列都達到100%相同,S蛋白則與武漢病毒達到97.7%相似。


黃色高亮區顯示,新馬蹄蝠病毒和武漢病毒整體同源性達到96.2%E蛋白達到100%一致。(G-NEWS)

病毒學專家、前Walter Reed陸軍研究所病毒系實驗室主任肖恩林(Sean Lin)指出,這是繼舟山病毒之後,又一種冠狀病毒和武漢病毒出現E蛋白100%相似,這是極其不尋常的現象。

他認為,目前的研究結果也發現E蛋白的基因序列可以有很高的彈性空間,換言之,這個E蛋白的很多位點可以有基因變化,但是卻不會影響它協助病毒完成組裝過程。也就是說,並沒有超強的選擇壓力來迫使E蛋白維持整個蛋白基因序列的高保真度。

四、穿山甲之謎:突如其來的「中間宿主」

與上次SARS疫情不同,這次武漢肺炎疫情從爆發至今,官方一直聲稱蝙蝠很可能就是武漢新冠病毒的自然宿主,但即便國家級專家組對華南海鮮市場進行了全面調查后,官方仍然未能宣布是哪種野生動物引發了這場「國難」。中間宿主的缺失,也因此成為外界質疑病毒來源的一大疑點。

27日,遠離武漢達一千多公里的廣州傳出消息,當地華南農業大學發布最新研究稱,穿山甲或為新型冠狀病毒的潛在中間宿主。

華南農業大學校長劉雅紅在發布會上透露,華南農業大學、嶺南現代農業科學與技術廣東省實驗室教授沈永義、肖立華等科研人員通過分析一千多份宏基因組樣品,在穿山甲身上發現一種β冠狀病毒與武漢新冠病毒或有密切聯繫。

該團隊還在發布會上宣稱,通過進一步對該病毒進行分離鑒定,電鏡下觀察到典型的冠狀病毒顆粒結構;最後通過對病毒的基因組分析,發現分離的病毒株與目前感染人的武漢新冠病毒毒株序列的相似度高達99%。以上結果表明,穿山甲為新型冠狀病毒的潛在中間宿主。

這是繼石正麗團隊123日宣稱鎖定武漢新冠病毒自然宿主僅僅半個月後,又一個有關武漢新冠病毒高效曝出的重量級消息。

如此重大的新聞自然引發大陸媒體迅速跟進。28日,《南方日報》獨家採訪了華南農業大學的有關專家,令外界了解到有關穿山甲冠狀病毒一些不尋常的實情。

華農獸醫學院研究院的沈永義在採訪中表示,發現攜帶病毒的穿山甲樣本並非來自廣東,也不是來自某個特定種群。這批穿山甲是他們「從某些特定機構獲取的」。


《南方日報》報導截圖

該團隊成員、華農獸醫學院教授馮耀宇在接受另一家大陸傳媒財新網的採訪時,直言不諱地表示,這批穿山甲實際是「應某些單位之邀」,為「判斷病因」而獲得的某些樣品,且樣品量「並不是特別大」。


財新網報導截圖

顯然,這批穿山甲是一批具有特殊性的樣本,因為沈永義坦承,他們自己搜集的國內常見的中華穿山甲樣本中,並未發現這樣的病毒。至於「某特定機構」為何主動找上門提供給他們這些特殊的樣本,報導中沒有提及。

在談到「穿山甲冠狀病毒如何感染人」這個最關鍵問題的時候,馮耀宇回答說:「這批穿山甲是一個特殊的群體,是有病症的。能否傳染人,我們目前還不明確,需要相關部門的進一步研究驗證。」

財新網的報導中更引述第三方專家的話指出,華農團隊從穿山甲身上分離到的病毒基因序列中,還有大約4000個沒有測序、尚不明確的核苷酸(新冠病毒約有29410個核苷酸),仍需進一步分析。報導並說,要確定穿山甲為新冠潛在的中間宿主,專家認為「需要更多證據」。

既然證據不足,穿山甲冠狀病毒能否感染人的關鍵問題也不確定,甚至在蝙蝠如何感染了穿山甲的過程也不清楚的情況下,華農團隊為何要貿然宣布穿山甲就是中間宿主、就是無數專家正千方百計尋找的從蝙蝠到人之間的那座「橋樑」呢?

華農專家在接受《南方日報》採訪時承認,一般科學家會先發表學術論文,然後才宣布成果,這次論文還沒寫就先開新聞發布會宣布結果,是「為了響應國家的號召」,並且「對我們而言壓力非常大」。

病毒專家董宇紅女士對此質疑:如果這幾隻被認為是「中間宿主」的穿山甲並非來自廣東,它們是如何進入雲南蝙蝠山洞中,感染了三個病毒株,然後又如何歷盡跋涉將病毒帶回廣東,最後又穿越千山萬水回到湖北武漢引發疫情的呢?

五、武漢病毒所:輿論風暴中心的P4實驗室

對石正麗團隊研究成果的質疑,使外界追索病毒來源的目光逐漸聚焦在武漢病毒所。畢竟,這裡擁有中國病毒研究領域最高等級的P4實驗室。

從武漢整個疫情爆發伊始,武漢病毒研究所保持了一種反常的安靜。這個病毒研究所從誕生那時起,就經歷了一系列的波折,似乎在預示這個研究所註定會不平凡。

123日,武漢剛宣布封城,法國「挑戰網」即刊登文章[15],披露了中法合作於武漢設立P4實驗室的諸多令人不安的細節。

文章指,由於法國是全球病毒研究領域的領先國家,早在2003年,中國科學院就向法國政府提出協助中國開設最高等級的病毒研究中心的要求。中方的要求曾引發法國政府及病毒專家們之間的分歧,因為儘管中國病毒中心可以打擊突發傳染病,但有法國專家擔心中共會使用法國技術來研製生物武器,法情報部門當時向政府提出嚴正警告。

在時任總理拉法蘭的支持下,中法雙方於2004年在一片爭議聲中籤署了合作建設P4病毒中心的協議。

法國對外安全總局警告,法國里昂的一家建築設計所RTV原定負責該實驗室的工程,但2005年中共官方選擇武漢當地設計所IPPR(中元國際工程有限公司)負責該工程,而根據法國安全部門的調查,IPPR設計所與中共軍隊下屬部門有密切關聯,這些部門早已是美國中央情報部門的監督目標。

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法國挑戰網關於武漢P4實驗室的報導截圖

公開資料顯示,IPPR(中元國際工程有限公司)創建於1953年,隸屬於中共大型央企、世界500強企業——中國機械工業集團有限公司(國機集團)。國機集團是中共機械工業規模最大的大型央企集團,與中共軍方關係密切,其下屬12個部門中,設立有專門的「軍工管理辦公室(科技發展部)」。


中國紅十字會前項目高管李原接受自由亞洲電台的採訪指出,中科院武漢病毒所從建設之初,透明度就嚴重不足。該P4實驗室圖紙由法國提供,原設計是層層負壓,在病毒實驗室中心形成一個「黑洞」,外界所有東西只向中心流動而不會反向流動泄露出來。

李原認為,中方不讓法方施工,目的就是要新建不讓法方知道的東西。

與此同時,有美國媒體認為,這些「不讓法方知道的東西」與生物武器有關。

124日,《華盛頓時報》(Washington Times)刊發了一篇記者比爾戈茨(Bill Gertz)對前以色列軍事情報官員丹尼肖漢姆(Dany Shoham)的採訪報導[16]。肖漢姆在採訪中明確表示,武漢病毒研究所與北京的秘密生物武器項目有關。

肖漢姆擁有醫學微生物學博士學位,1970年到1991年期間,他在以色列軍事情報部門擔任高級分析師,領中校軍銜,負責中東和世界的生物及化學戰議題。作為生物戰專家,肖漢姆毫不隱諱地指出,武漢肺炎這種致命傳染病可能在全球範圍內傳播,而其來源就是與中共秘密生物武器計劃有關的武漢實驗室。

他表示,中共一貫否認擁有任何進攻性生物武器,但美國國務院在去年的一份報告中指出,懷疑中共政府從事秘密生物戰研發計劃。

肖漢姆進一步指出,武漢病毒研究所隸屬於中國科學院,但該研究所中的某些實驗室與中共軍隊或中共生物武器項目有關。而且該研究所並非唯一的存在,中共還有另外三個研究所在從事生物武器方面的開發。

很早以前,中共即已進行生物武器研發。1993年,中共公布了武漢第二個生物領域的機構——武漢生物製品研究所。這是中共於1985年加入的《生物武器公約》(BWC)涵蓋的八個生物戰研究機構之一。

肖漢姆還明確表示,SARS病毒總體上已被納入中共生物武器項目,而武漢的P4實驗室還儲存著許多致命病毒,包括埃博拉(Ebola)、尼帕(Nipah)和克里米亞-剛果出血熱(Crimean-Congo hemorrhagic fever)病毒。

儘管中共對有關武漢病毒所的不利傳聞實施了全面的封殺,但國內同樣不斷傳出質疑的聲音。

23日,大陸名為「武小華」的人士在微博上實名發帖,質疑石正麗涉嫌人工干預病毒,並披露大陸醫學實驗室普遍管理混亂,實驗動物有的成為寵物,有的被賣,甚至很多直接被吃掉。

24日中午,多益網路董事長徐波又在微博上發布長文,宣布實名舉報中科院武漢病毒研究所涉嫌泄露病毒導致2019新冠狀病毒疫情爆發。

27日,法廣引述大陸消息指,有中共軍方「首席生化武器專家」之稱的軍事醫學科學院生物工程研究所所長陳薇,已經正式接管武漢病毒研究所P4實驗室。

214日下午,習近平主持舉行中共全面深化改革委員會第十二次會議。在這次會上,習近平第一次提出,把生物安全納入國家安全體系,系統規劃國家生物安全風險防控和治理體系建設,同時,還要儘快推動出台生物安全立法,加快構建國家生物安全法律法規體系、制度保障體系。

目前,武漢新冠肺炎的疫情仍然在全世界蔓延。這場從武漢爆發的世紀瘟疫已經被認為是自西班牙流感以來,對人類威脅最大的傳染病。而更為嚴峻的情況是,處於疫情爆發中心的中國大陸,諸多重要信息依然不透明,其中包括至關重要的病毒來源問題。

25日,美國國會眾議院首次就有關問題召開聽證會。其間多位議員質疑北京當局隱瞞中國境內疫情狀況,並指世界衛生組織(WHO)所扮演的角色正失去公信力。

213日,美國國家經濟委員會主任庫德洛在白宮接受記者採訪時表示,美方對其專家未受邀前往中國應對疫情以及中方缺乏信息透明度,均感到「有點失望」。而美國總統川普(特朗普)同日亦公開提到,雖然他對北京有信心,但也了解中國官員不願提供資訊,「我認為,他們想粉飾太平。」

稍早,美國廣播公司ABC26日報導說,鑒於有關武漢疫情的真假信息泛濫,要求美國科學家和醫學研究人員調查武漢冠狀病毒的來源。白宮科研政策辦公室(OSTP)主任凱爾文德羅格邁爾(Kelvin Droegemeier)向美國國家科學院、工程院以及醫學院發信,要求專家與科學家們儘快查出新冠病毒的源頭,更好地了解冠狀病毒在動物/人類間傳播以及環境等各個方面的問題,以便為將來的疫情做準備。

國際社會的介入正在釋放積極信號,或許新冠病毒(COVID-19)的來源之謎,會在不久的將來得到揭示,讓人們能夠有更充分的信心面對這場災難。

(新冠病毒探源調查組由一批關心新冠病毒疫情的海外專家、學者組成。)

*****
[1] 
Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, Chinahttps://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30183-5/fulltext

[2] http://china.caixin.com/2020-02-05/101511802.html

[3] Biorxiv. Full-genome evolutionary analysis of the novel coronavirus (2019-nCoV) rejects
the hypothesis of emergence as a result of a recent recombination event. D. Paraskevis, et al.
, https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.26.920249v1.full.pdf

[4] A new coronavirus associated with human respiratory disease in China,
https://www.nature.com/articles/s41586-020-2008-3. 
【張永振論文全文編譯:http://news.bioon.com/article/6749934.html

[5] https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30251-8/fulltext
Notably, 2019-nCoV was closely related (with 88% identity) to two bat-derived severe acute respiratory syndrome (SARS)-like coronaviruses, bat-SL-CoVZC45 and bat-SL-CoVZXC21, collected in 2018 in Zhoushan, eastern China, but were more distant from SARS-CoV (about 79%) and MERS-CoV (about 50%).

[6] Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding, https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30251-8/fulltext

[7]  Genomic characterization and infectivity of a novel SARS-like coronavirus in Chinese batshttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6135831/

[8] Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins andreceptor bindinghttps://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30251-8/fulltext#%20

[9]  Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins andreceptor bindinghttps://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30251-8/fulltext#%20

[10] Clock and TMRCA based on 27 genomeshttp://virological.org/t/clock-and-tmrca-based-on-27-genomes/347

[11] Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) proteins of different bat species confer variable susceptibility to SARS-CoV entryhttps://link.springer.com/article/10.1007/s00705-010-0729-6

[12] Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptorhttps://www.nature.com/articles/nature12711

[13] A SARS-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergencehttps://www.nature.com/articles/nm.3985?fbclid=

[14] A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat originhttps://www.nature.com/articles/s41586-020-2012-7

[15] https://www.challenges.fr/entreprise/sante-et-pharmacie/coronavirus-en-chine-apres-le-sras-la-sulfureuse-cooperation-franco-chinoise-a-wuhan_695165.amp?__twitter_impression=true

[16] https://www.washingtontimes.com/news/2020/jan/24/virus-hit-wuhan-has-two-laboratories-linked-chines/

 

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發表評論 評論 (13 個評論)

回復 NO_meansNO 2020-2-23 05:23
信息量好大,好有說服力,證據鏈好清晰,三好文章,頂!
文兄辛苦了。
看過此文章,對武漢病毒來源還有疑問?只能說永遠叫不醒裝睡的人。
請造謠美國投毒的5毛大V出來走兩步,臆測不是證據。理解你們反美是工作,可是成功要靠實力和理據。請問諸位5毛大V,Where's the beef?
回復 yysjl 2020-2-23 05:38
NO_meansNO: 信息量好大,好有說服力,證據鏈好清晰,三好文章,頂!
文兄辛苦了。
看過此文章,對武漢病毒來源還有疑問?只能說永遠叫不醒裝睡的人。
請造謠美國投毒的5毛大
只說一句,共匪完了
回復 文廟 2020-2-23 05:57
今天又開放, 但已經改了。

2020年2月21 日:

"Page not found.

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回復 文廟 2020-2-23 05:59
NO_meansNO: 信息量好大,好有說服力,證據鏈好清晰,三好文章,頂!
文兄辛苦了。
看過此文章,對武漢病毒來源還有疑問?只能說永遠叫不醒裝睡的人。
請造謠美國投毒的5毛大
他們不會回答具體問題的, 只會找些「大牌」子「磚家」來忽悠幾下。
回復 文廟 2020-2-23 06:00
yysjl: 只說一句,共匪完了
完了還沒那麼快, 但會掙扎的!
回復 亦云 2020-2-23 09:05
這次疫情非但搬起石頭砸向自己的雙腳還把整個海外華裔圈也攪和的人心惶惶
回復 文廟 2020-2-23 09:42
亦云: 這次疫情非但搬起石頭砸向自己的雙腳還把整個海外華裔圈也攪和的人心惶惶
"搬起石頭砸自己的腳" 是再恰當不過的了!
回復 NO_meansNO 2020-2-23 10:27
.
文廟: 他們不會回答具體問題的, 只會找些「大牌」子「磚家」來忽悠幾下。
假如大V們肯下功夫找「大牌專家」還算做了努力,更多時候能省就省,播放一段5毛小粉紅和網紅胡言亂語的短視頻,然後自編自演,在群里評論區里你一句我一句,玩起東北二人轉,目的賺人氣。讓人又好氣又好笑。
回復 文廟 2020-2-24 00:35
NO_meansNO: .假如大V們肯下功夫找「大牌專家」還算做了努力,更多時候能省就省,播放一段5毛小粉紅和網紅胡言亂語的短視頻,然後自編自演,在群里評論區里你一句我一句,玩
那些「大牌專家」, 不可能真的懂如何去blast基因序列。

27個「磚家『可以胡弄全世界? 正好間接認識兩位。其中, 一位中國人, 港大的。 他懂病毒? 幾乎所有華人都知道: 懂的一個姓管,被趕出武漢(1月21日), 一個姓袁, 另一個現任院長僅懂一半, 流行病的。誰相信那個中國人, 港大的磚家? 他可能連基因順序, 都看不懂。

有一個美國專家, 90多歲了, 也能看懂基因順序? 不過他以前在大陸有生意, 孩子還在打理。 同不會玩手機一樣的事情。

不過, 鑒定DNA這事, 其實只需本科水平的知識。
回復 mycn2008 2020-2-24 01:52
文廟: 他們不會回答具體問題的, 只會找些「大牌」子「磚家」來忽悠幾下。
博主,寫得很辛苦,其實中共派誰出來說你們也不會信,還不如不出來,老老實實的把疫情解決掉
回復 NO_meansNO 2020-2-24 04:15
mycn2008: 博主,寫得很辛苦,其實中共派誰出來說你們也不會信,還不如不出來,老老實實的把疫情解決掉
除了維穩費,每年大外宣經費是另一筆巨大開支,為了在海外說好中國故事,花錢雇傭各式各樣千軍萬馬。問題是說故事是一回事,說「好」故事是另一回事,為什麼用盡心機還是沒人信?因為民主社會言論自由,信息全面公開,正常思維的人通過對比能分辨事非,不要怪別人不信,怪就怪中共說謊上了癮。
回復 文廟 2020-2-24 07:30
mycn2008: 博主,寫得很辛苦,其實中共派誰出來說你們也不會信,還不如不出來,老老實實的把疫情解決掉
就像「狼來了『的故事一樣, 謊話說多了, 真話也沒人信了。 何況就病毒來源一事, 至今沒有真話!
如果能拿出一篇文章, 以上篇為例, 一條一條的論證, 找出科學依據, 有基本的邏輯, 有基本的事實, 誰會不相信?
因為拿不出來, 只好拿」牌子「來砸。 以為能找到100個若貝爾獎得主背書, 不講具體證據, 別人就會信?
這個在大陸的底層, 可能行的通。
回復 文廟 2020-2-24 07:30
NO_meansNO: 除了維穩費,每年大外宣經費是另一筆巨大開支,為了在海外說好中國故事,花錢雇傭各式各樣千軍萬馬。問題是說故事是一回事,說「好」故事是另一回事,為什麼用盡
這次中共要臭遍全世界了!

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