6月5日,中共中央和國務院發布告全國人民書,將運動定性為「反革命暴亂」。
被當局稱為「黑手」的天體物理學家方勵之和妻子李淑嫻教授逃入美國駐北京大使館避難。
中國其它地方持續爆發抗議當局鎮壓北京學生和市民的示威遊行。6月5日,四川省會成都市的軍警全面鎮壓已經佔領市中心人民廣場的學生和市民。有消息說,成都市死亡的市民超過兩百人。憤怒的市民防火焚燒了位於市中心的人民商場。
6月9日,中共實際的最高領袖鄧小平在中南海接見戒嚴部隊高級軍官。
6月12日,當局陸續宣布通緝方勵之夫婦和王丹、吾爾開希、柴玲和李錄等21名學運領袖以及工人抗議領袖韓東方和知識分子嚴家其、包遵信等多人,在北京和各地逮捕了大批參加示威的人士。
6月24日,中國官方正式宣布罷免趙紫陽職務,原中共政治局委員、上海市委書記江澤民升任中共中央總書記。
隨後,中國政府在全國展開大規模秋後算帳,全國約有兩萬人被捕,其中1.5萬人被以「反革命罪」判刑,70多人被判死刑和死緩,在北京市至少有10名市民被以「反革命暴徒」罪名公開執行槍決。
從1989年4月到6月期間,由於有亞銀理事會會議和戈爾把喬夫訪華,大批海外媒體記者聚集北京,並把整個事件向全世界及時播報。由於電視的普及,六四事件成為世界全球數十億觀眾第一個看到的現場報道的政府鎮壓民眾事件,引起了極大的反響。
美國總統老布希譴責中國政府踐踏人權。英國法國西德加拿大澳大利亞等國政府紛紛譴責鎮壓。美國和歐盟隨後對中國實施一系列制裁,包括武器禁售。
中國政府的聲譽在全球急劇下跌,大量親中共媒體倒閉。如在香港,由中國政府出資支持的文匯報,在六四當天以「痛心疾首」四個字作為當天的社論。隨後,該社社長李子誦、總編輯金堯如、副總編輯程翔和多位采編人員辭職。
6月25日,中國中央電視台播放了中國實際最高領導人鄧小平在6月9日在中南海的講話。
鄧小平認為,國際大氣候和國內小氣候決定六四事件必然會發生,遲早要來。事實上,六四事件本身只是國際上僵持三十多年的冷戰格局發生巨變的開始。
1989年6月,波蘭反對派組織在議會和參議院選舉中獲得巨大成功。1990年12月,團結工會領袖瓦文薩在全國大選中當選為波蘭總統,團結工會踏上執政道路,而波蘭統一工人黨失去政權,從此未能返回政治舞台。
1989年11月9日,分隔東西德國的標誌柏林牆被民眾推倒,次年,原屬共產主義陣營的東德和資本主義陣營的西德合併,使得二次世界大戰之後的兩個德國成為一個實行民主政治的統一德國。
1989年9月,匈牙利社會主義工人黨和反對派達成協議,刪除憲法中「工人階級的馬克思列寧主義的黨是社會的領導力量」等條款;改國名「匈牙利人民共和國」為「匈牙利共和國」。
1989年11,捷克斯洛伐克首都布拉格爆發超過十萬人的遊行抗議,要求結束共產黨統治。在隨後的大選中,反對派「公民論壇」獲得勝利,剛剛刑滿出獄的著名劇作家哈維爾擔任總統,完成該國政權的和平轉移。
1989年11月,保加利亞共產黨總書記日夫科夫辭職。1990年2月,共產黨自行放棄一黨專政體制,黨名也改為保加利亞社會黨。同年6月,保加利亞舉行了首次自由選舉,保加利亞成為多黨制國家。同年11月,國名改為保加利亞共和國。
1989年12月,羅馬尼亞首都布加勒斯特爆發大規模示威遊行,示威群眾和警察部隊爆發衝突。由於軍隊拒絕鎮壓普通民眾,導致羅馬尼亞共產黨內部分裂,反對派成立了救國陣線。12月25日,救國陣線臨時軍事法庭判決齊奧塞斯庫夫婦犯有屠殺罪和非法擁有大量來源不明財產罪,並於當日執行槍決。羅馬尼亞共產黨政權正式倒台。
1990年3月,阿爾巴尼亞實行首次多黨參加的全國選舉,產生了第一個選舉產生的政府,近五十年的由阿爾巴尼亞工人黨一黨專政的局面結束,工人黨改名為社會黨。
1991年12月25日晚,全世界所有的人注視著莫斯科紅場上發生的蘇聯歷史上的最後一幕:從克里姆林宮的旗杆上,飾有鐮刀斧頭和紅色五角星的蘇聯國旗緩慢降下,宣告這個世界上歷史最長面積最大的共產黨專制國家徹底消失。