尼羅河水天上來

https://big5.backchina.com/?335112

GISAID 進化樹證明新冠病毒起源

作者：尼羅河水天上來於 2020-3-26 19:35 發表於最熱鬧的華人社交網路--貝殼村

作者分類:健康凈土|通用分類:熱點雜談

廣義而言，地球上所有生命起源於共同的祖先。縮小尺度，所有國家新冠病毒都有一個共同的冠狀病毒起源。但是是不是所有的新冠病毒都起源於同一個新冠病毒，就是一個等待回答的問題。問題關鍵在於這個新字，廣義而言冠狀病毒每天都是新的。因為世界上不存在不變的事物。但是，新冠病毒的新，是特別指在某個地區引發大流行的一個特定的「新冠病毒」，問題於是就變成這樣：在不同國家地區導致大流行的新冠病毒是由一個國家地區發生的新冠病毒傳播擴散，還是由冠狀病毒在不同的地區獨立發生。

作為理論假設，當然兩者都有存在的可能，正是因為存在兩種可能性，所以不能把其中任何一種作為不證自明的公理。尼羅河從中醫理論出發，認為多起源的可能性更大。理由在《武漢病毒還能走多遠》和《美國新冠病毒還能走多遠》兩篇文章中有具體闡述。同時指出，新冠病毒的起源最後要依靠大量的病毒序列比較才能作出結論。現在，證據正在越來越清晰地在世人面前展現。

GISAID 彙集全球各實驗室1442份新冠病毒基因組測序結果，生成了新冠病毒進化樹。圖中實測樣本以各色圓點表示。從左向右水平方向的連線是病毒進化線。表示病毒基因組發生鹼基突變。線條長度與鹼基取代數量相關，並且與時間相關。垂直連線不代表鹼基取代，只是為了在同一平面上顯示同時發生的進化線。

https://nextstrain.org/ncov?c=country&l=unrooted

從2019年12月3日到2020年2月26日，主要樣本來自以中國為主的亞洲地區（藍紫色圓點），從2020年2月26日到三月11日。測序樣本主要來自歐洲（黃綠色）和北美（紅色）。藍紫色點形成上中下分佈的三個集群。中間數量最多。黃綠色點形成右側上下兩群分佈，以上部數量較多。紅點集中分佈於右側上方，右側中部和下部有少量散在分佈。

水平線相連色點表明左側病毒是右側病毒的祖先。圖中只有很少不同色點的水平直線連接。絕對多數的情況都是相同色點的水平連接。表明只有極少的紅色樣本來自藍紫或者黃綠，同樣也只有極少的藍紫樣本來自紅色樣本或者黃綠樣本。

人們最關心的問題是有沒有找到作為所有新冠病毒祖先的「根」。從圖示可見所有連接顏色樣本點的水平連線在不同位置與垂直連線相交，最後彙集到圖像最左側的一條垂線。也就是說理論上它必然來自同一個來源。而且這個來源理論上還可以通過水平線向左側與更早的起源相連。但是，理論上假設的這個來源並沒有顯示任何實際樣本測序證明它的物理存在。最左側的垂直線上沒有任何代表樣本基因組的色點。這種情況被稱為「任意根」（arbitrary root）。如果從任何一個紅點出發（美國樣本）向左側尋找水平連接，最多情況下它的左側還是紅點。與最左側的紅點相連的就是所有色點的共同祖先arbitrary root。藍紫點，黃綠點的情況同樣如此。

目前生成的新冠病毒進化樹表明亞洲，歐洲，美洲的新冠病毒是獨立發生的。並沒有發現一個可以作為美國新冠病毒祖先的中國新冠病毒，同樣，也沒有發現一個可以作為歐洲病毒祖先的中國新冠病毒。作為美國病毒祖先的歐洲病毒同樣也不存在。

一個明顯的缺陷是人們無法得到1月15日之前的美國新冠病毒和歐洲新冠病毒。所以無法知道在這個時間點之前美國和歐洲的新冠病毒與中國新冠病毒是非存在聯繫。以目前的科學證據，如果新冠病毒是自然發生的，更大可能是在多中心同時或者先後發生。任何將病毒起源政治化的做法都是沒有科學依據的，對人類的和平進步沒有任何正能量推動作用。