在甘肅艱苦的條件下,袁錦楣醫生不僅辦好了腦系科,還協同病毒所下放甘肅的基礎研究人員開始將免疫學應用於臨床。他於1975年應用腦脊液內測出麻疹IGM抗體,在中國首先活體診斷了二例亞急性硬化性全腦炎。在當時文革尚未結束。中華醫學雜誌全部停辦的情況下。他在廣東省辦的新醫學上發表了全國第一篇和神經免疫有關的論文(注1),和第一篇有關的文獻綜述。1977年並發表在中華醫學雜誌外文版(Chinese Med J)。由於中國從來沒有報道過中國有亞急性硬化性全腦炎病例,所以30本英文單行本被國外同行很快索要而空。
1980年4月,袁錦楣被衛生部調回北京,重新回到北大醫院神經科工作,同年晉陞為副教授。並擔任神經科副主任及神經病學研究室主任。1980年當年袁錦楣即在神經病學研究室內建立了中國第一個獨立的神經免疫實驗室(注2)。開展寡克隆區帶及腦脊液內各種抗體的檢測。1985年初袁錦楣以客座副教授身份公費到美國Johns Hopkins Hospital 神經科從事免疫學研究。師從重症肌無力免疫學說創始人Daniel B Drachman. 他是國際知名的神經免疫專家。袁錦楣教授跟他一起做了2年多有關神經免疫學的研究。
其中郭玉璞 和李春岩都是提到格林-巴利綜合征的軸索變異型的,李春岩是Guy M Mckhann 提出的中國癱瘓症論文作者之一,但經過袁錦楣的論文認為這些病不是新病。仍舊是格林-巴利綜合征,不過和美國的不同而是表現有軸索損害。李春岩的論文已經放棄了他原來也署名的論文。而採用袁錦楣的論點。說明了袁錦楣教對中國格林-巴利綜合征研究的成就。