近幾年的研究發現,一些非發育性的疾病也跟基因印跡有關。2002年美國約翰斯·霍普金斯大學的研究人員在《美國醫學遺傳學雜誌》上發表的一項研究稱,使人患晚發性阿爾茨海默病(late-onset Alzheimer)的基因變異大部分都來自於母親,這很可能與基因印跡有關。1995年在Scientific American Mind上發表的另一項研究發現,雙向情感障礙也遺傳自母親;1997年《神經病學》上發表的一項研究顯示,遺傳自父親的妥瑞症(Tourette』s disorder)比遺傳自母親的妥瑞症發病時間晚,且癥狀有所不同——這再次暗示(但還沒有被證實)這些疾病可能與印跡有關。「有許多證據都需要聯繫起來考慮,」美國聖菲研究所(Santa Fe Institute)的進化理論學家喬恩·威爾金斯(Jon Wilkins)這樣說道。
科學家不僅發現了基因印跡在精神疾病中的作用,還揭示出父母對孩子大腦和行為的影響具有不對稱性。1995年在《美國國家科學院院刊》和1996年在《腦發育研究》上發表的兩項研究具有里程碑式的意義。在這兩項研究中,英國劍橋大學發育生物學家E·巴里·克韋恩(E. Barry Keverne)和同事發現,某些腦區幾乎完全由母源基因控制,而另一些腦區則幾乎完全由父源基因控制。在正常小鼠胚胎只有幾個細胞的時候,研究人員把它們與只帶有親代一方染色體的兩細胞胚胎共同放置在培養皿中。結果這些小鼠胚胎要麼主要表達父方的基因,要麼主要表達母方的基因。